根據環境部初步統計，中央和地方政府這些年累計投資1140億元，新增污水管網19872公里，新建污水處理廠(設施)305座，新增污水處理能力1415萬噸/日。
到目前為止，中國城市污水處理率仍然較低。另外，有些污水處理技術在不同程度上存在著基建造價和運行成本較高、處理效率有待提高等問題。
由于已建成的污水處理廠中，多數污水處理廠屬于縣級污水廠，處理規模較小，周邊又缺乏使用再生水的用戶，而且只有部分污水處理廠規劃了中水利用方案，所以回用水中水僅占設計規模很小的比例。
同時，一些污水再生利用設施建成后，由于管網建設及有關政策的不配套，造成設施閑置，難以發揮其經濟效益和社會效益。
在現有體制下，有些地方處理經費不能及時到位，使得一些污水處理廠有多少經費就處理多少水，這樣就不能夠充分發揮污水處理廠應有的效益，并且使得大量儀表、設備擱置受損。
因為經費緊張，致使設備保養、維修不到位，提前報廢，同時也無法發揮污水處理專業管理人員的作用，形成人力、物力、財力的嚴重浪費。另外，導致有些地方污水處理廠在運營方面出現諸多問題。
具體表現如下：
1、污水處理能力不足
這種問題很普遍，例如，有些地方本來應該擴建污水處理能力80萬噸/日，然而直至去年年底，當地才啟動60萬噸/日污水處理能力建設，典型的“超負荷運行”。
2、提標改造滯后
有些園區每天的工業污水排入當地河流，總氮濃度超標嚴重；有些地方污水廠1級a標準都達不到。
3、偷排
很多企業生產的廢水未經處理直排。埋設暗管分流污水，后又臨時封堵偷排口，導致大量工業廢水通過暗管直排；
4、管網建設滯后
污水管網缺口較大，生活污水溢流問題比較普遍；部分區域管網雨污不分、混接錯接，汛期污水直排問題嚴重；
5、建設滯后
有些地方污水處理廠很早就立項，直到去年才建成調試，之前的污水都直排了。
6、超標排放
有些地方污水處理廠出水總磷最高濃度超標嚴重，氨氮等超標問題也很突出。
7、運行不規范
很多自建自營企業污水處理設施大多運行不正常、監管不到位，不但中水不回用，且大量污水直排；集中處理設施普遍運行不規范。
8、非法處置
有些運營單位還向未取得危險廢物經營許可證的企業轉移或以副產品名義出售黑色水解物等危險廢物。
9、不及時處置
有些企業停產后固廢危廢長期未清理到位。
隨著污水處理廠的快速發展，污水處理廠的運營者必須改進污水處理技術，完善無數處理設備，加強節能減排工作，提高能源利用率，解決相應的運營問題。
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